Guillaume COGNE

• Analyse et modélisation des micro-organismes photosynthétiques, par le couplage du transfert radiatif, des cinétiques biologiques, de la bioénergétique et du métabolisme cellulaire.
• Conception, modélisation et intensification des photobioprocédés, de l'échelle cellulaire à celle du photobioréacteur, pour la valorisation du CO₂ et la production photosynthétique de molécules d'intérêt.
• Instrumentation, suivi en ligne et estimation d'état des photobioprocédés, notamment à partir de l'analyse des échanges gazeux, des bilans de matière et de modèles mécanistes.

Parcours académique

2025 – Habilitation à Diriger des Recherches (HDR), Nantes Université

2003 – Doctorat en Génie biochimique, Université Blaise Pascal (Clermont-Ferrand)

2000 – DEA Nutrition et Sciences des Aliments, Université Blaise Pascal

1999 – Diplôme d’ingénieur en Génie biologique, CUST (aujourd’hui Polytech Clermont-Ferrand)

Fonctions actuelles

• Maître de conférences HDR, Polytech Nantes, Nantes Université
• Chercheur au GEPEA (UMR CNRS 6144)
• Responsable du Work Package 5 du projet européen Horizon Europe Solar to Butanol (S2B)
• Chairman de la section Microalgae Bioengineering de l’European Society of Biochemical Engineering Sciences (ESBES)
• Responsable pédagogique de la 3ᵉ année du cursus Génie des Procédés et des Bioprocédés (Polytech Nantes)

Recherche

Mes activités de recherche s'inscrivent dans le domaine du génie des bioprocédés appliqué aux micro-organismes photosynthétiques. Elles visent à analyser, modéliser et prédire le fonctionnement des photobioprocédés à partir des couplages entre phénomènes de transport, transfert radiatif, transferts gaz-liquide, cinétiques biologiques et métabolisme cellulaire.

Mes travaux reposent sur une approche d'analyse de systèmes associant bilans de matière et d'énergie, caractérisation expérimentale, modélisation mécaniste et estimation de variables biologiques à partir de mesures en ligne. Une attention particulière est portée aux relations entre l'énergie lumineuse absorbée, sa conversion par les processus photosynthétiques, l'allocation du carbone et les performances macroscopiques du procédé.

Ces approches sont mobilisées pour la conception, le dimensionnement, la conduite et l'intensification des photobioréacteurs, notamment pour la valorisation du CO₂ et la production photosynthétique de molécules d'intérêt.

Enseignement

J’enseigne le génie des bioprocédés, le génie de la réaction biologique, la modélisation des procédés et le génie des procédés à Polytech Nantes, ainsi que dans le Graduate Programme Green Factories et en formation doctorale. Mes enseignements s’appuient sur une articulation étroite entre approches théoriques, modélisation, expérimentation et apprentissage par projet.

Responsabilités scientifiques

• Responsable de Work Package – Horizon Europe Solar to Butanol (S2B)
• Président de la section Microalgae Bioengineering (ESBES)
• Expertise pour plusieurs revues internationales (Biotechnology and Bioengineering, Biotechnology Progress, Biochemical Engineering Journal, Bioresource Technology, Metabolic Engineering)
• Évaluateur pour des organismes nationaux et internationaux de financement de la recherche  

Encadrement

• 8 thèses de doctorat soutenues
• 5 doctorants actuellement encadrés
• Encadrement de stages de Master et de projets de recherche

Quelques chiffres

• HDR obtenue en 2025
• Plus de 29 publications dans des revues internationales à comité de lecture
• Plus de 1 900 citations (Google Scholar)
• h-index : 18
• Participation à plusieurs projets européens, ANR et PEPR

Profils scientifiques

• Google Scholar
• HAL
• ResearchGate
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